Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Greb1Q3UHK3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms