Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc177Q3UHB8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc177Q3UHB8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms