Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc58Q3UGP9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms