Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3U6N9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3U6N9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms