Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U595 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U595 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U595 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U595 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U595 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U595 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U595 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U595 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U595 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U595 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U595 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U595 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U595 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U595 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U595 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U595 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U595 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U595 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U595 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U595 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U595 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U595 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U595 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U595 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U595 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U595 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U595 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U595 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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