Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc174Q3U155 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc174Q3U155 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms