Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc9Q3U0M1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms