Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3TTL0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3TTL0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTL0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTL0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3TTL0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms