Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxw18Q3TSA9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxw18Q3TSA9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms