Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CiartQ3TQ03 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CiartQ3TQ03 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms