Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cwc27Q3TKY6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cwc27Q3TKY6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms