Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smarca4Q3TKT4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Smarca4Q3TKT4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smarca4Q3TKT4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms