Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Usp39Q3TIX9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp39Q3TIX9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms