Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc69Q3TCJ8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms