Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VrtnQ3SYK4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms