Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr27Q3SYJ2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms