Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp8Q2V6D6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms