Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo3Q2TJ95 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo3Q2TJ95 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms