Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrna5Q2MKA5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna5Q2MKA5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna5Q2MKA5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms