Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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