Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim71Q1PSW8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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