Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf3ip1Q149C2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Traf3ip1Q149C2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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