Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rtel1Q0VGM9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rtel1Q0VGM9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms