Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Ttc39dQ0VF76 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Ttc39dQ0VF76 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Ttc39dQ0VF76 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Ttc39dQ0VF76 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Ttc39dQ0VF76 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Ttc39dQ0VF76 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Ttc39dQ0VF76 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc39dQ0VF76 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Ttc39dQ0VF76 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Ttc39dQ0VF76 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Ttc39dQ0VF76 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms