Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb8Q0VBD0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb8Q0VBD0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms