Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cntnap5cQ0V8T7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms