Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spata18Q0P557 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms