Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubxn2bQ0KL01 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms