Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf541Q0GGX2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms