Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc4Q08624 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc4Q08624 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms