Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kcnma1Q08460 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms