Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MestQ07646 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MestQ07646 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MestQ07646 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MestQ07646 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MestQ07646 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MestQ07646 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MestQ07646 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MestQ07646 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MestQ07646 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MestQ07646 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MestQ07646 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MestQ07646 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MestQ07646 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MestQ07646 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MestQ07646 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MestQ07646 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MestQ07646 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MestQ07646 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MestQ07646 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MestQ07646 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MestQ07646 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MestQ07646 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MestQ07646 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MestQ07646 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MestQ07646 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms