Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cntn3Q07409 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntn3Q07409 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms