Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp2Q06649 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp2Q06649 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms