Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprgQ05909 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprgQ05909 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprgQ05909 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms