Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs3Q05895 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms