Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Top1Q04750 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Top1Q04750 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Top1Q04750 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Top1Q04750 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Top1Q04750 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Top1Q04750 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Top1Q04750 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Top1Q04750 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Top1Q04750 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms