Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kcnb1Q03717 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kcnb1Q03717 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms