Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tff2Q03404 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms