Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Msx2Q03358 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Msx2Q03358 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms