Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddr1Q03146 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms