Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1sQ02789 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cacna1sQ02789 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1sQ02789 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms