Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col6a2Q02788 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms