Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gjb5Q02739 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb5Q02739 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms