Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb4Q02738 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms