Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RykQ01887 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RykQ01887 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RykQ01887 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RykQ01887 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RykQ01887 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RykQ01887 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RykQ01887 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RykQ01887 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RykQ01887 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RykQ01887 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RykQ01887 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RykQ01887 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RykQ01887 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RykQ01887 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RykQ01887 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RykQ01887 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RykQ01887 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RykQ01887 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RykQ01887 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RykQ01887 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RykQ01887 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RykQ01887 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RykQ01887 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RykQ01887 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RykQ01887 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RykQ01887 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RykQ01887 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RykQ01887 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RykQ01887 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RykQ01887 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RykQ01887 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RykQ01887 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RykQ01887 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RykQ01887 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RykQ01887 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RykQ01887 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RykQ01887 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RykQ01887 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RykQ01887 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RykQ01887 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RykQ01887 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RykQ01887 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms