Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VcpQ01853 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VcpQ01853 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VcpQ01853 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VcpQ01853 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VcpQ01853 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VcpQ01853 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VcpQ01853 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VcpQ01853 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VcpQ01853 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms