Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mc1rQ01727 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mc1rQ01727 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms