Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HmgcrQ01237 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HmgcrQ01237 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HmgcrQ01237 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HmgcrQ01237 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HmgcrQ01237 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HmgcrQ01237 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HmgcrQ01237 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HmgcrQ01237 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HmgcrQ01237 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HmgcrQ01237 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HmgcrQ01237 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HmgcrQ01237 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms