Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PrcdQ00LT2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrcdQ00LT2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms